栏舍清洗消毒可以使猪舍里的病原微生物感染负荷显著降低，减少猪舍病原载量，达到提高猪群健康水平避免损失的目的。严格的清洗消毒不光是控制急性传染病（大肠杆菌病毒、猪痢疾）爆发的重要预防措施，也可以在猪群猪群发生慢性病（肠炎）时，减少药物需求量，提高生长性能。

只有通过的清洗，用水和清洁剂的浸泡，使生物膜更好的完全打开，释放出微生物，再用一定水压冲洗，才能清除这些残存于漏缝地板、水泥地面、料槽生物膜中的细菌。有研究发现，使用不同清洗方法猪舍细菌计数会有显著差异，显然热水加清洁剂后的活菌数远远低于仅仅用清水冲洗。

预先浸润+清洗剂+水清洗的方式耗时最短，可以节省46%左右的时间成本。加拿大爱德华王子岛大学Atlantic兽医学院的Dan Hurnik博士曾通过实验发现，采用热水高压冲洗机械用热水进行冲洗，可以大大提高清洗效率。先洒水对猪圈进行浸润，软化干燥的污物和粪便，然后采用高压冲洗机进行冲洗，可以节约50%左右的冲洗时间。

爱尔兰农业发展咨询机构Teagsc还发现，清洗圈舍更符合工作常规，因为浸渍可进行于夜间而无需人们照看。此外，还可减少清洗时的用水量，从而减少污水量。